安徽医科大学与复旦大学等一研究成果掀开“主要抗原”神秘面纱

05.06.2016  13:13

日前,国际著名学术期刊《自然遗传》以论著的形式在线全文发表了安医大第一附属医院、复旦大学皮肤病研究所与华大基因共同完成的人类MHC(主要组织相容性复合体)区域全覆盖深度测序的研究成果,该研究成功构建出迄今为止最完整的中国汉族人群MHC遗传变异数据库(Han-MHC),并阐述了其在复杂疾病研究中的重要价值。研究通过自主研发的MHC目标区域捕获芯片,对大规模中国人群20,635例样本的MHC目标区域进行高深度重测序及其分析,成功建立世界上最大样本量的中国人群MHC全区域完整遗传变异数据库。

MHC又被称作HLA(人类白细胞表面抗原),位于6号染色体6p21.3区域,包括一系列紧密连锁的基因座,与人类免疫系统功能密切相关,涉及肿瘤、自身免疫性疾病、免疫缺陷性疾病、过敏性疾病、感染类疾病、代谢性疾病等几乎所有复杂疾病的发生、发展,被称为人类的“主要抗原”,阐明该区与疾病的关系一直是生命医学研究领域的热点和难点。近年来,欧洲人群利用已建立的5225例来自I型糖尿病联盟的MHC区域遗传变异参考图谱,开展了众多欧洲人群复杂疾病的MHC关联性研究。由于缺乏大样本量的中国人群MHC遗传变异参考图谱,目前国内鲜有利用精细定位策略寻找MHC区域与中国人群复杂疾病相关致病性的变异研究。因此,亟待针对中国人群MHC区域展开大规模、系统性遗传学研究,建立起中国人群特异性MHC区域遗传多态性图谱。

此项研究是首次对中国人群的MHC区域进行大规模样本深度测序。通过自主研发的MHC目标区域捕获芯片,对20635例人群样本的MHC目标区域进行高深度测序和分析,成功建立世界上最大样本量的中国汉族人群MHC全区域完整遗传变异数据库。通过对MHC区域准确的序列分析和基因分型,完整展示出中国人群MHC区域突变位点和HLA基因的多态性图谱,为开展中国人群复杂疾病与MHC区域的相关性研究奠定坚实基础。研究以银屑病为案例,首次采用测序的方法对MHC区域遗传变异在中国汉族银屑病人群发病中的相关性进行了全面、系统的大样本研究,发现了多个新的银屑病易感基因和位点,同时揭示了中国人群特异的银屑病易感位点,进一步证明了基于完整测序构建的Han-MHC数据库在中国人群相关复杂疾病研究中的巨大应用价值。

该项目负责人、安医大张学军教授表示,该成果将为深入研究MHC区域遗传多态性在中国人群复杂疾病发生、发展中的相关机制提供新的契机,特别是对我国正在进行的各种复杂疾病的精准医学研究将起到重要作用。同时该研究为进一步探索MHC区域遗传多态性在自身免疫性疾病、感染性疾病、肿瘤、过敏性疾病等所有与MHC相关的复杂疾病中的作用机制提供了一个完整的遗传变异比对图谱。该研究发现的MHC区域遗传变异靶标,将为免疫相关疾病的预测、早期诊断、药物疗效和副作用观察,以及靶向治疗的精准医学研究提供重要的参考数据。

该论文的第一作者为安徽医科大学皮肤病研究所周伏圣、左先波、张晓光,以及华大基因曹红志、张涛、刘小敏六位博士,通讯作者为安医大张学军教授、孙良丹教授,华大基因研究院王俊研究员,瑞典卡罗琳斯卡医学院的LennartHammarstrm教授。(特约通讯员:王晶晶)