1997 年8 月30 日，本公司在安徽省工商行政管理局领取企业法人营业执照，注册号为25922200-8。
1998 年11 月26 日，经安徽省体改委皖体改函字(1998)88 号文批准，本公司进行了增资扩股：安徽蚌埠涂山制药厂以其生产经营性资产评估后净值1,260 .33 万元投入本公司，按1.05:1 的比例折为国有法人股1,200.31 万股；安徽省马鞍山生物化学制药厂以其经营性资产评估后净值714 万元投入本公司，按1.05 :1 的比例折为国有法人股680 万股；安徽省药物研究所以其拥有本公司的62.5 万元债权出资，折国有法人股59.52 万股。股本总额增至4,000.23 万元，并于19 98 年11 月30 日办理了工商变更登记。
2000 年9 月4 日，经中国证券监督管理委员会以证监发行字(2000)123 号文核准，本公司向社会公开发行人民币普通股2,500 万股。
2000 年9 月7 日，本公司采用向一般投资者上网定价发行方式向社会公开发行普通股2,500 万股,发行后的注册资本变更为人民币6,500.23 万元。
2003 年10 月10 日，经本公司临时股东大会决议通过,以本公司截至2003 年6 月30 日止的总股本6,500.23 万股为基数，向全体股东按每10 股派送2 股红股，同时用资本公积向全体股东按每10 股转增股本8 股，送股后的注册资本变更为人民币13,000.46 万元。
2005 年5 月31 日，经本公司2004 年年度股东大会决议通过，以本公司截至 2004 年12月31 日止的总股本13,000.46 万股为基数，用资本公积向全体股东按每10 股转增股本10股，转股后的注册资本变更为人民币26,000.92 万元。
2005 年12 月28 日，本公司召开股权分置改革相关股东会议，表决通过了安徽丰原药业股份有限公司股权分置改革方案。根据股权分置改革方案，流通股股东每持有10 股流通股股份获得非流通股东支付3.5 股股份对价，并于2006 年1 月13 日实施完毕。股权分置改革完成后，本公司总股本仍为人民币26,000.92 万元。
2014年3月24日，丰原药业发布公告，称拟以7.81元/股定增不超过3072.98万股收购普什制药100%的股权，同时以不低于7.03元/股定增不超过1137.98万元募集配套资金。普什制药100%股权预估交易价格为2.4亿元，但是增值率仅为6%。
